个体运输户王某将其自有的“东风”牌卡车向保险公司投保了机动车辆保险。在保险期间内王某驾驶卡车运货途中与甲运输公司的“黄河”牌卡车相撞，两车受损.该事故由“黄河”牌卡车司机违章造成，“黄河”牌卡车司机应对“东风”牌卡车的损失负全责。为使事故得到迅速解决，甲运输公司与王某达成协议：由甲运输公司一次性付给王某5000元，由王某自行修理受损的“东风”牌卡车。后王某修理“东风”牌卡车实际支付修理费6800元。王某要求保险公司赔偿修理费l800元。保险公司认定“东风”牌卡车的保险金额是出险时重值的90%，保险公司应赔付6120元。但鉴于王某与甲运输公司已有赔偿协议，保险公司拒绝赔偿。王某遂诉至法院，请求法院判决保险公司赔付修理费1800元。

问：本案中保险公司是否有权拒赔?请说明理由。