北方摩托车制造公司建造了一座自动化仓库作为中间仓库，存放装配汽车所需的各种零配件。该公司所需的零配件大多数是由其协作厂生产，然后运至自动化仓库。该自动化仓库分为高库和整理室两部分，高库是采用固定式高层货架与巷道堆垛机结构，从整理室到高库之间设有辊式输送机，利用输送机进行零配件的搬运。当入库的货物包装规格不符合托盘或标准货箱时，则还需要对货物的包装进行重新整理，这项工作是在整理室进行。由于各种备品的包装没有规格化，因此，整理的工作量相当大。货物的出入库是运用电脑控制与人工操作相结合的人机系统。该自动化仓库建在企业的东南角，距离装配车间较远，因此，在仓库与装配车间之间需要进行二次运输，即将所需的零配件先出库，装车运输到装配车间，然后才能进行组装。自动化仓库建成后，这个先进设施在企业的生产经营中所起的作用并不理想。因此其利用率也逐年下降。你认为应该采取哪些有效的措施来帮助该公司改进物流中的问题？